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采收加工当菌盖四周白色生长圈消失，整个菌盖呈红褐色，出现咖啡色粉末状孢子时，即可摘下子实体。一般从接种至米收约需50~60d，米后置竹帘上晒干，也可低温烘干。若要收孢子粉可以采用套袋法或架子闭封法收集，然后再摘取子实体。灵芝以其独有的医学特性、保健特性，广受市场热宠。灵芝种植技术在汉中不断探索、研究、改进，总结出了适合本地种植的技术，尤其是将穴空接种改为断面接种，较大的提高了工作效率、减少了用工、节省了支出，同时采取断面接种方法，菌丝萌发集中快速，成功率高，可在灵芝生产基地应用。芝菌种植以周期短、见效快、收入稳而在汉中迅速发展，现将近年来的种植技术归纳
酸、碱降解法．酸、碱降解法利用无机或有机酸、碱等破坏灵芝孢子细胞壁中几丁质、纤维素等成分的结构，使其有效成分易于溶出．使用无机酸或有机酸溶液热处理灵芝孢子提取灵芝多糖，后多糖中分子量在2000~4900Da的部分均在60%以上.物理法物理法的工作原理各异，优缺点也不相同，总体来说，物理法的能量消耗较大，且设备较为复杂、投资较大．低温冷冻法．低温冷冻法利用灵芝孢子中的水分在低温条件下结晶、结晶长大等作用破坏灵芝孢子细胞壁．例如，金刚阴在实验中将灵芝抱子在-20T反复冻融，其破壁率高达99.5%．超声波法．
栽培季节安排不当一是芝棒制作及接种期安排过晚（如2月以后），如春季突遇高温天气，发菌棚内温度达到40弋以上,极易“烧菌”，菌丝生理活动受到限制并逐渐死亡，各种杂菌趁机感染。二是芝棒制作及接种期安排过早（如11月以前），接种期间气温高，杂菌活跃，菌棒易感染。芝场环境污染主要是上年度染杂菌袋和出过芝的老袋以及当年污染的菌袋在房前、屋后、马路边、芝场旁边晾晒，没有及时清理销毁，致使大量霉菌孢子在空气中飞扬，造成环境污染。段木基质变质主要是装袋时气温较高，装袋后放置时间过长，没有及时灭菌；料袋灭菌时升温时间过长；段木基质水份含量过大，均可造成段木基质变性发酸等。
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